LifeLines: Lineas de vida en Python

 Fuente: https://lifelines.readthedocs.io/en/latest/index.html

Líneas de vida¶

lifelines es una biblioteca completa de análisis de supervivencia, escrita en Python puro. Qué ¿Qué beneficios tienen las líneas de vida?

• Fácil instalación

• métodos de trazado interno

• API sencilla e intuitiva

• maneja datos censurados a derecha, izquierda e intervalo

• Contiene los modelos paramétricos, semiparamétricos y no paramétricos más populares

>>pip install lifelines # instalación de la librería
>>import matplotlib.pyplot as plt
>>import numpy as np
>>from lifelines import *

>>fig, axes = plt.subplots(3, 3, figsize=(13.5, 7.5))

>>kmf = KaplanMeierFitter().fit(T, E, label='KaplanMeierFitter')
>>wbf = WeibullFitter().fit(T, E, label='WeibullFitter')
>>exf = ExponentialFitter().fit(T, E, label='ExponentialFitter')
>>lnf = LogNormalFitter().fit(T, E, label='LogNormalFitter')
>>llf = LogLogisticFitter().fit(T, E, label='LogLogisticFitter')
>>pwf = PiecewiseExponentialFitter([40, 60]).fit(T, E, label='PiecewiseExponentialFitter')
>>ggf = GeneralizedGammaFitter().fit(T, E, label='GeneralizedGammaFitter')
>>sf = SplineFitter(np.percentile(T.loc[E.astype(bool)], [0, 50, 100])).fit(T, E, label='SplineFitter')

>>wbf.plot_survival_function(ax=axes[0][0])
>>exf.plot_survival_function(ax=axes[0][1])
>>lnf.plot_survival_function(ax=axes[0][2])
>>kmf.plot_survival_function(ax=axes[1][0])
>>llf.plot_survival_function(ax=axes[1][1])
>>pwf.plot_survival_function(ax=axes[1][2])
>>ggf.plot_survival_function(ax=axes[2][0])
>>sf.plot_survival_function(ax=axes[2][1])